各個過濾器的阻力差別會影響風量平衡和氣流均勻，安裝時應將阻力過高或過低的個別過濾器剔除，將阻力大小相近的過濾器安排在同一房間中，同一房間中不同阻力的過濾器也宜均勻分散位置。 按《潔凈室施工及驗收規(guī)范》規(guī)定，應符合以下關系：每臺阻力實際值（額定風量下）=（0.95~1.05）×送風面上各臺實際阻力平均值。按GB/T6165-1985《過濾器性能試驗方法 透過率和阻力》規(guī)定的方法檢驗，其透過率≤0.1%（即效率≥99.9%）或對粒徑≥0.1μm微粒的計數透過率≤0.001%(即效率≥99.999%)的過濾器為過濾器。
過濾器初阻力不得超過產品樣本阻力的10%，而且因為更換后的新過濾器阻力小，空調負荷大大減少，而過濾器更換的費用遠小于空調運行所需的電費，頻繁更換前級預過濾器實際上是使空調在低阻力負荷下運行，節(jié)省了大量電費;過濾器積灰阻力增加，當阻力增大到某一規(guī)定值時過濾器報廢，有時過大的阻力會使過濾器上已捕捉到的灰塵飛散，出現這種危險過濾器更應該報廢及及時更換新過濾器。新過濾器的（zui低過風風速下的）阻力稱“初阻力”，對應過濾器報廢時的阻力稱“終阻力”，大多數情況下終阻力。
過濾器應符合防火要求，過濾器按耐火程度分為三級：1級過濾器，過濾器全部材料都是不燃性的，不燃性材料應符合GB8624-1997 *。2級過濾器，過濾器濾料應為符合GB8624-1997 *的不燃性材料，分隔板、框架可用符合GB8624-1997 B2級的可燃性材料。3級過濾器，過濾器全部材料可用符合GB8624-1997 B3級設計時，可按初阻力的二倍為終阻力，作為過濾器的計算阻力。有些生物實驗室和與危險品打交道的實驗室，在開展一項新的重要課題前，為了可靠會要求使用新的過濾器。 
初效過濾器一般2-3個月更換一次，每半年更換一次，這樣過濾器的壽命一般能在2年以上。但為保護后級別過濾器使用及保障潔凈室安全運行，許多聰明的業(yè)主每月更換初效，每3個月更換中效及亞（或者前面所述風柜內末段選用做保護過濾器），這樣可以保證過濾器5年（甚至10年）以上的使用壽命。